La gran expedición científica de la ilustración española es la de Alejandro Malaspina y su colega José de Bustamante y Guerra. Entre 1788 y 1794 cartografiaron muchas de las islas y costas del Pacífico. Los naturalistas de la tripulación, como Antonio Pineda, recogieron un inventario botánico de 14.000 plantas y otro zoológico de más de 500 especies (357 aves, 124 peces, 36 cuadrúpedos y 21 anfibios).