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Presentan un programa gratuito para visualizar bases de datos de proteínas

Un grupo de investigadores del Centro Nacional de Biotecnología (CNB) del CSIC ha desarrollado un programa gratuito para visualizar mejor una base de datos proteómica, en la que se almacena a gran escala la información sobre proteínas. Se trata del programa PRIDEViewer, para el repositorio PRIDE (PRoteomics IDEntifications database).

Programa PRIDEViewer. Imagen: CNB-CSIC.

Para facilitar el manejo de los datos de proteínas existentes en el repositorio PRIDE, el grupo de Juan Pablo Albar del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC pone de forma gratuita a disposición de toda la comunidad científica el programa PRIDEViewer.

La enorme de cantidad de datos biológicos que se tienen en la actualidad hacen necesaria una estandarización a la hora de presentarlos. Es la única manera de que se pueda tener una acceso sencillo a todos ellos y desde cualquier laboratorio del mundo. En el caso de la proteómica, el repositorio PRIDE facilita la obtención y tratamiento de los mismos gracias al formato XML.

Sin embargo, el manejo de documentos XML no facilita la visualización de los datos, por lo que en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, el grupo de Juan Pablo Albar ha desarrollado un programa gratuito, PRIDEViewer, que facilita enormemente esta tarea.

Con PRIDEViewer se une así la facilidad de compartir los datos de la espectrometría de masas que proporciona el formato XML con una interfaz gráfica gracias a la cual el usuario puede manejar sus datos de una manera sencilla e intuitiva.

El hecho de estar desarrollado con Java permite que pueda ser utilizado desde cualquier ordenador, independientemente del sistema operativo que se utilice.

Fuente: Centro Nacional de Biotecnología del CSIC
Derechos: Creative Commons
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