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Expertos españoles han desarrollado una herramienta que permite recopilar información útil sobre los tratamientos o las enfermedades asociadas a la esclerosis múltiple y que contiene tanto artículos científicos como historias clínicas. Los resultados se publican en Plos One.
Investigadores del IDIBAPS y del Hospital Clínic de Barcelona han creado la primera representación informática que contiene conocimiento sobre la esclerosis múltiple (EM) para avanzar en la investigación traslacional y clínica de la enfermedad. Esta herramienta permite recopilar información útil sobre los tratamientos o las enfermedades asociadas a la EM y que contienen tanto artículos científicos como historias clínicas.
La EM es una enfermedad crónica y de larga evolución desde que aparecen los primeros síntomas y para entenderla bien es necesario integrar una gran cantidad de información que proviene de diversas fuentes.
En el estudio, coordinado por Pablo Villoslada, jefe del grupo IDIBAPS Patogenética y nuevas terapias en Esclerosis Múltiple, han participado Xavier Pastor y Raimundo Lozano de la Unidad de Informática Médica del Hospital Clínic y Albert Sáiz, del servicio de Neurología del hospital.
Esta herramienta contiene, de forma explícita, conocimiento disponible sobre una enfermedad en concreto, las enfermedades secundarias y las relaciones que puedan existir entre ellas (comorbilidad), y que permite extraer información. Se trata de un sistema muy potente ya que los conceptos están perfectamente identificados y la información contenida es independiente del idioma o de los sinónimos que se puedan emplear para designar un mismo concepto.
En el artículo que publica la revista Plos One, los investigadores utilizaron herramientas para el análisis de texto y escanearon, en paralelo, los datos de las historias clínicas anonimizadas de más de 600 pacientes con EM del Clínic y los artículos científicos relacionados con esta enfermedad que aparecen en PubMed, el portal de búsqueda de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE UU. De aquí se extrajeron las entidades conceptuales relacionadas con la enfermedad y otros datos para elaborar la ontología.
Para validar esta herramienta, los investigadores cruzaron los resultados de las dos aproximaciones (historias clínicas de pacientes y artículos sobre EM referenciados en Pubmed) para encontrar las comorbilidades y comprobaron que las enfermedades coexistentes encontradas eran las mismas. También les permitió descubrir relaciones que no estaban descritas en los textos.
Esta ontología médica, la primera que existe para EM, ya se ha puesto a disposición de la comunidad científica, ya que está en el repositorio de ontologías Bioportal del Centro Nacional Americano para Ontologías Biomédicas, y permitirá avanzar en la investigación clínica y traslacional de esta enfermedad.
Referencia bibliográfica:
Malhotra A, Gündel M, Rajput AM, Mevissen HT, Saiz A, Pastor X, Lozano-Rubi R, Martinez-Lapiscina EH, Zubizarreta I, Mueller B, Kotelnikova E, Toldo L, Hofmann-Apitius M, Villoslada P. Knowledge retrieval from PubMed abstracts and electronic medical records with the Multiple Sclerosis Ontology. PLoS One. 2015 Feb 9;10(2):e0116718. doi: 10.1371/journal.pone.0116718. eCollection 2015. PMID: 25665127
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